Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q1T7F1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q1T7F1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q1T7F1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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