Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC5A12Q1EHB4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC5A12Q1EHB4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms