Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IMPG1Q17R60 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IMPG1Q17R60 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms