Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK4Q16099 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK4Q16099 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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