Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZFHX3Q15911 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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