Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CUL3Q13618 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms