Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF5Q13568 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF5Q13568 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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