Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DNAJC3Q13217 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DNAJC3Q13217 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms