Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RLFQ13129 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RLFQ13129 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RLFQ13129 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLFQ13129 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLFQ13129 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLFQ13129 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLFQ13129 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLFQ13129 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLFQ13129 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RLFQ13129 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RLFQ13129 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RLFQ13129 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RLFQ13129 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RLFQ13129 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RLFQ13129 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLFQ13129 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLFQ13129 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLFQ13129 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLFQ13129 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RLFQ13129 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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