Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACACAQ13085 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACACAQ13085 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms