Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM32Q13049 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM32Q13049 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
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