Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDC16Q13042 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDC16Q13042 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms