Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ECH1Q13011 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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