Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GRIN2AQ12879 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
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