Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 PKH3YDR466W 2697 nt1.63□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 snR56snR56 88 nt1.63□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.63□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 YPL261CYPL261C 309 nt1.63□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 PEP1YBL017C 4740 nt1.63□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 VPS15YBR097W 4365 nt1.63□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 GUP1YGL084C 1683 nt1.63□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 VPS34YLR240W 2628 nt1.63□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 OSH6YKR003W 1347 nt1.63□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.62□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 ISF1YMR081C 1017 nt1.62□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.62□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 MSC6YOR354C 2079 nt1.62□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 DAD4YDR320C-A 219 nt1.61□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 HIT1YJR055W 495 nt1.61□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 YKL083WYKL083W 615 nt1.61□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 YBL012CYBL012C 402 nt1.61□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 YOR121CYOR121C 306 nt1.61□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 PEX8YGR077C 1770 nt1.61□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 SWI5YDR146C 2130 nt1.61□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 ALK2YBL009W 2031 nt1.61□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 IRC20YLR247C 4671 nt1.6□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 FKS1YLR342W 5631 nt1.6□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt1.6□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 SAR1YPL218W 573 nt1.6□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 IRR1YIL026C 3453 nt1.6□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 SEC31YDL195W 3822 nt1.6□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 HDA3YPR179C 1968 nt1.59□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 AIM9YER080W 1884 nt1.59□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 YGR250CYGR250C 2346 nt1.59□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 ATP6Q0085 780 nt1.59□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 RPS27AYKL156W 249 nt1.59□□□□□ -2.15
TPT1Q12272 SSQ1YLR369W 1974 nt1.59□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 TFC8YPL007C 1767 nt1.59□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YLR419WYLR419W 4308 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 MMS22YLR320W 4365 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 PRE4YFR050C 801 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 MBB1YJL199C 327 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YML003WYML003W 873 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 PXA2YKL188C 2562 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 MON2YNL297C 4911 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YJR039WYJR039W 3366 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 LHS1YKL073W 2646 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 NOP53YPL146C 1368 nt1.58□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 IRE1YHR079C 3348 nt1.57□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 GIM4YEL003W 336 nt1.57□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 ABM1YJR108W 372 nt1.57□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 FMP23YBR047W 528 nt1.57□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YPL229WYPL229W 621 nt1.57□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 SEC63YOR254C 1992 nt1.57□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.56□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YBL073WYBL073W 312 nt1.56□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 HHT1YBR010W 411 nt1.56□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 INO80YGL150C 4470 nt1.56□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 ZRG17YNR039C 1818 nt1.56□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 MYO2YOR326W 4725 nt1.56□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 RLM1YPL089C 2031 nt1.56□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 SBE22YHR103W 2559 nt1.55□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 SAP190YKR028W 3102 nt1.55□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.55□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.55□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.55□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YBR012CYBR012C 420 nt1.55□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 CTR9YOL145C 3234 nt1.55□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 SEY1YOR165W 2331 nt1.55□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 UTP22YGR090W 3714 nt1.54□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 snR70snR70 164 nt1.54□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 SRP14YDL092W 441 nt1.54□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.54□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YGR265WYGR265W 411 nt1.54□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YHL041WYHL041W 450 nt1.54□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YOR029WYOR029W 336 nt1.54□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 UTP21YLR409C 2820 nt1.53□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 CYC7YEL039C 342 nt1.53□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 VTC1YER072W 390 nt1.53□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 RTR1YER139C 681 nt1.53□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 PSY1YKL076C 384 nt1.53□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 YOP1YPR028W 543 nt1.53□□□□□ -2.16
TPT1Q12272 SAC3YDR159W 3906 nt1.53□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 MSH5YDL154W 2706 nt1.53□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 LYS14YDR034C 2373 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 RTP1YMR185W 2946 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 GCN4YEL009C 846 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 EMP24YGL200C 612 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YGR035CYGR035C 351 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 IRC23YOR044W 474 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 TDA9YML081W 3756 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 SWI6YLR182W 2412 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 MDM20YOL076W 2391 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 MAK10YEL053C 2202 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 FRK1YPL141C 2598 nt1.52□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YJR003CYJR003C 1560 nt1.51□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 EFR3YMR212C 2349 nt1.51□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 PAC1YOR269W 1485 nt1.51□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 PAU3YCR104W 375 nt1.51□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 RPL31AYDL075W 342 nt1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 91.7 ms