Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 BRP1YGL007W 378 nt2.22□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 NOP10YHR072W-A 177 nt2.22□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 RPS27AYKL156W 249 nt2.22□□□□□ -2.05 RIP-Chip
PUF2Q12221 YEL043WYEL043W 2871 nt2.22□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 CBF2YGR140W 2871 nt2.22□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 DNF1YER166W 4716 nt2.22□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 NUP170YBL079W 4509 nt2.21□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 SSQ1YLR369W 1974 nt2.21□□□□□ -2.05
PUF2Q12221 RAD61YDR014W 1944 nt2.21□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YFH1YDL120W 525 nt2.21□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 FMP16YDR070C 282 nt2.21□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 SMD1YGR074W 441 nt2.21□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 SDH2YLL041C 801 nt2.21□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR294CYLR294C 330 nt2.21□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 ABF2YMR072W 552 nt2.21□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.21□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 NUP100YKL068W 2880 nt2.21□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 RBK1YCR036W 1002 nt2.2□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 PHS1YJL097W 654 nt2.2□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 SAR1YPL218W 573 nt2.2□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YCL023CYCL023C 348 nt2.2□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 GIS1YDR096W 2685 nt2.2□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 TOF1YNL273W 3717 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 TRA1YHR099W 11235 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 MRP10YDL045W-A 288 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YRB1YDR002W 606 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YGL069CYGL069C 465 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YIL032CYIL032C 357 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YIL059CYIL059C 366 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YLR053CYLR053C 327 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 SGD1YLR336C 2700 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YLL032CYLL032C 2478 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 VPS35YJL154C 2835 nt2.19□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 UFD4YKL010C 4452 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 TAE2YPL009C 3117 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 COG8YML071C 1824 nt2.19□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 SPF1YEL031W 3648 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 PUT3YKL015W 2940 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 RIM20YOR275C 1986 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 HCS1YKL017C 2052 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YGL041CYGL041C 204 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YHL041WYHL041W 450 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YHL042WYHL042W 453 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 DOT6YER088C 2013 nt2.18□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YCK3YER123W 1575 nt2.18□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 YFR016CYFR016C 3702 nt2.17□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 TIM9YEL020W-A 264 nt2.17□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 APQ12YIL040W 417 nt2.17□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 RPL38YLR325C 237 nt2.17□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 YNL198CYNL198C 303 nt2.17□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 SNC1YAL030W 354 nt2.16□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 PAU8YAL068C 363 nt2.16□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.16□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 PAU20YOL161C 363 nt2.16□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 HHT1YBR010W 411 nt2.16□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBR064WYBR064W 429 nt2.16□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 PAN3YKL025C 2040 nt2.16□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 BNI1YNL271C 5862 nt2.16□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 DFG16YOR030W 1860 nt2.16□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 TOR1YJR066W 7413 nt2.16□□□□□ -2.06
PUF2Q12221 SAP185YJL098W 3177 nt2.15□□□□□ -2.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 EMP24YGL200C 612 nt2.15□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.15□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 YPR063CYPR063C 423 nt2.15□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 TOF2YKR010C 2316 nt2.15□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 NPC2YDL046W 522 nt2.14□□□□□ -2.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 PRE4YFR050C 801 nt2.14□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.14□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 SNC2YOR327C 348 nt2.14□□□□□ -2.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 MMS22YLR320W 4365 nt2.14□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 GUP1YGL084C 1683 nt2.14□□□□□ -2.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 RRP6YOR001W 2202 nt2.14□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 SPO22YIL073C 2928 nt2.13□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 UBR1YGR184C 5853 nt2.13□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 UBP15YMR304W 3693 nt2.13□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 PAM16YJL104W 450 nt2.13□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 IRA2YOL081W 9240 nt2.13□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 SSD1YDR293C 3753 nt2.12□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 RPA34YJL148W 702 nt2.12□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 DGR1YNL130C-A 147 nt2.12□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 VMA9YCL005W-A 222 nt2.12□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 IRC8YJL051W 2469 nt2.12□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 AFI1YOR129C 2682 nt2.11□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 RPS17AYML024W 411 nt2.11□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.11□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 IES4YOR189W 351 nt2.11□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 NUT2YPR168W 474 nt2.11□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 SOK2YMR016C 2358 nt2.1□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 STH1YIL126W 4080 nt2.1□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 RAV1YJR033C 4074 nt2.1□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 YOL098CYOL098C 3114 nt2.1□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 PCC1YKR095W-A 267 nt2.1□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.1□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 MDM20YOL076W 2391 nt2.1□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 HDA3YPR179C 1968 nt2.1□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 SCW11YGL028C 1629 nt2.09□□□□□ -2.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 snR55snR55 98 nt2.09□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 ISD11YER048W-A 285 nt2.09□□□□□ -2.07
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