Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	AHC1	YOR023C	1701 nt		1.37	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	DOT6	YER088C	2013 nt		1.37	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	BST1	YFL025C	3090 nt		1.37	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		1.37	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	PAU18	YLL064C	363 nt		1.37	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	PAU6	YNR076W	363 nt		1.37	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	TRM3	YDL112W	4311 nt		1.37	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	CAT8	YMR280C	4302 nt		1.36	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	PAN3	YKL025C	2040 nt		1.36	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	YNL114C	YNL114C	372 nt		1.36	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	TOM22	YNL131W	459 nt		1.36	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	YBR032W	YBR032W	303 nt		1.36	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	CTF4	YPR135W	2784 nt		1.36	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	Q0017	Q0017	162 nt		1.36	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	GNT1	YOR320C	1476 nt		1.36	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	RLM1	YPL089C	2031 nt		1.35	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	YDR509W	YDR509W	348 nt		1.35	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	NBL1	YHR199C-A	222 nt		1.35	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	PFD1	YJL179W	330 nt		1.35	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	YLR171W	YLR171W	390 nt		1.35	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	MSH5	YDL154W	2706 nt		1.35	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	HMI1	YOL095C	2121 nt		1.34	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	SPC98	YNL126W	2541 nt		1.34	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	SNF5	YBR289W	2718 nt		1.34	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	Q0144	Q0144	330 nt		1.34	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	YHR125W	YHR125W	306 nt		1.34	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	YPR177C	YPR177C	372 nt		1.34	□□□□□ -2.19
VIK1	Q12045	OSH6	YKR003W	1347 nt		1.34	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YNL284C-B	YNL284C-B	5268 nt		1.34	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	CTR9	YOL145C	3234 nt		1.34	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	NOP53	YPL146C	1368 nt		1.34	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	PMD1	YER132C	5262 nt		1.33	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	RSM22	YKL155C	1887 nt		1.33	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	TRM732	YMR259C	4263 nt		1.33	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YDR008C	YDR008C	351 nt		1.33	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	URM1	YIL008W	300 nt		1.33	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YSW1	YBR148W	1830 nt		1.33	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	IRE1	YHR079C	3348 nt		1.33	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	CDC36	YDL165W	576 nt		1.32	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YOR192C-C	YOR192C-C	237 nt		1.32	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	snR54	snR54	86 nt		1.32	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YLR422W	YLR422W	5799 nt		1.32	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	FRK1	YPL141C	2598 nt		1.32	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	MSN5	YDR335W	3675 nt		1.31	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YLR456W	YLR456W	615 nt		1.31	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YML009C-A	YML009C-A	327 nt		1.31	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	FMP23	YBR047W	528 nt		1.31	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	snR41	snR41	95 nt		1.31	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	KAP122	YGL016W	3246 nt		1.31	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	HDA3	YPR179C	1968 nt		1.3	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	RVS161	YCR009C	798 nt		1.3	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YGR265W	YGR265W	411 nt		1.3	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YHR052W-A	YHR052W-A	195 nt		1.3	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YHR054W-A	YHR054W-A	195 nt		1.3	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YIL020C-A	YIL020C-A	339 nt		1.3	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YJL022W	YJL022W	309 nt		1.3	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	RPL32	YBL092W	393 nt		1.3	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YJR098C	YJR098C	1971 nt		1.3	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	TOF2	YKR010C	2316 nt		1.29	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	ECL1	YGR146C	636 nt		1.29	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YLR202C	YLR202C	327 nt		1.29	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	RUF22	RUF22	515 nt		1.29	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YBL073W	YBL073W	312 nt		1.29	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	ZEO1	YOL109W	342 nt		1.29	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	ZRG17	YNR039C	1818 nt		1.29	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	MDS3	YGL197W	4464 nt		1.28	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	ALK1	YGL021W	2283 nt		1.28	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YDR003W-A	YDR003W-A	123 nt		1.28	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YGL239C	YGL239C	315 nt		1.28	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YJL015C	YJL015C	285 nt		1.28	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YLR101C	YLR101C	396 nt		1.28	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		1.28	□□□□□ -2.2
VIK1	Q12045	CDC25	YLR310C	4770 nt		1.28	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	MKT1	YNL085W	2493 nt		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	SWI5	YDR146C	2130 nt		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	MLH3	YPL164C	2148 nt		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	YER087C-A	YER087C-A	552 nt		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	NST1	YNL091W	3723 nt		1.27	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	UBC7	YMR022W	498 nt		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	YOL159C	YOL159C	516 nt		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	ERP4	YOR016C	624 nt		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	HHT1	YBR010W	411 nt		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	EST2	YLR318W	2655 nt		1.26	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	RAD9	YDR217C	3930 nt		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	PXA2	YKL188C	2562 nt		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	SRP14	YDL092W	441 nt		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	WIP1	YDR374W-A	270 nt		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	COF1	YLL050C	432 nt		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	YOP1	YPR028W	543 nt		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	SFB2	YNL049C	2631 nt		1.25	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	MAK10	YEL053C	2202 nt		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	CDC31	YOR257W	486 nt		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	SPO23	YBR250W	1572 nt		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	NCA2	YPR155C	1851 nt		1.24	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	PHS1	YJL097W	654 nt		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	VPS55	YJR044C	423 nt		1.23	□□□□□ -2.21
VIK1	Q12045	RRT15	YLR162W-A	189 nt		1.23	□□□□□ -2.21

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