Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAGPQ0VAQ4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAGPQ0VAQ4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMAGPQ0VAQ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMAGPQ0VAQ4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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