Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 PEP3YLR148W 2757 nt2.87□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 YSP2YDR326C 4317 nt2.87□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 SPO22YIL073C 2928 nt2.86□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 YKU80YMR106C 1890 nt2.86□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 CLN3YAL040C 1743 nt2.86□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 RPL23BYER117W 414 nt2.86□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 ECM12YHR021W-A 456 nt2.86□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 YNL114CYNL114C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 MMS22YLR320W 4365 nt2.86□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 PRP42YDR235W 1635 nt2.86□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 TOP2YNL088W 4287 nt2.85□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 ESL1YIL151C 3357 nt2.85□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 SPO75YLL005C 2607 nt2.85□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 RPH1YER169W 2391 nt2.85□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 HYP2YEL034W 474 nt2.85□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 ULI1YFR026C 510 nt2.85□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 BNR1YIL159W 4128 nt2.85□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 STB4YMR019W 2850 nt2.85□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 SMY1YKL079W 1971 nt2.84□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 LCL1YPL056C 306 nt2.84□□□□□ -1.95
AVO1Q08236 SMY2YBR172C 2223 nt2.84□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SSN2YDR443C 4263 nt2.83□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SNU13YEL026W 381 nt2.83□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YOR218CYOR218C 420 nt2.83□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 RTT10YPL183C 3042 nt2.83□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SUL1YBR294W 2580 nt2.83□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 ISW1YBR245C 3390 nt2.83□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 COS111YBR203W 2775 nt2.83□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 DRS2YAL026C 4068 nt2.83□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 RRP12YPL012W 3687 nt2.82□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SDC25YLL016W 3147 nt2.82□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 RIC1YLR039C 3171 nt2.82□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SPC98YNL126W 2541 nt2.82□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SRB8YCR081W 4284 nt2.82□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.82□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 ESC1YMR219W 4977 nt2.82□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 TFC4YGR047C 3078 nt2.82□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 PMP1YCR024C-A 123 nt2.81□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 snR72snR72 98 nt2.81□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 GIS1YDR096W 2685 nt2.81□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 CHS2YBR038W 2892 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 RFX1YLR176C 2436 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SGM1YJR134C 2124 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YIL080WYIL080W 4722 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 PNC1YGL037C 651 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YHR210CYHR210C 1026 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 MDM1YML104C 3384 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 PTP3YER075C 2787 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 DUG2YBR281C 2637 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 STE6YKL209C 3873 nt2.8□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YOR296WYOR296W 3870 nt2.79□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SCH9YHR205W 2475 nt2.79□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YEL073CYEL073C 324 nt2.79□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.79□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 RPL33BYOR234C 324 nt2.79□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 TOM1YDR457W 9807 nt2.79□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 KAP123YER110C 3342 nt2.79□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 TAE2YPL009C 3117 nt2.79□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SWI6YLR182W 2412 nt2.79□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SPO14YKR031C 5052 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 SNQ2YDR011W 4506 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 ACB1YGR037C 264 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 RPB10YOR210W 213 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YBR174CYBR174C 315 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 YBR277CYBR277C 402 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 POL3YDL102W 3294 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 FIR1YER032W 2631 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 ECM21YBL101C 3354 nt2.78□□□□□ -1.96
AVO1Q08236 VPS16YPL045W 2397 nt2.78□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YEF3YLR249W 3135 nt2.77□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 MCM10YIL150C 1716 nt2.77□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 RPL42BYHR141C 321 nt2.77□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 EMC6YLL014W 327 nt2.77□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 RPL42AYNL162W 321 nt2.77□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YBL109WYBL109W 336 nt2.77□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YLL007CYLL007C 1998 nt2.77□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 AFI1YOR129C 2682 nt2.76□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 RPL34BYIL052C 366 nt2.76□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 UBP14YBR058C 2346 nt2.76□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 MMS1YPR164W 4224 nt2.76□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 SEC7YDR170C 6030 nt2.76□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 CRM1YGR218W 3255 nt2.76□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 ILS1YBL076C 3219 nt2.75□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YOR345CYOR345C 351 nt2.75□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 SPO21YOL091W 1830 nt2.75□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 SNF5YBR289W 2718 nt2.74□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.74□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 SNC1YAL030W 354 nt2.74□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YLR012CYLR012C 300 nt2.74□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 CRS5YOR031W 210 nt2.74□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 SLY1YDR189W 2001 nt2.74□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YBT1YLL048C 4986 nt2.73□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 PUT3YKL015W 2940 nt2.73□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 LYS14YDR034C 2373 nt2.73□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YJL120WYJL120W 324 nt2.73□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.73□□□□□ -1.97
AVO1Q08236 RPS29AYLR388W 171 nt2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.8 ms