Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSBP1Q04837 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms