Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EMX1Q04741 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMX1Q04741 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms