Protein–RNA interactions for Protein: Q03579

LIP1, Ceramide synthase subunit LIP1, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LIP1Q03579 DOP1YDR141C 5097 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 SNO3YFL060C 669 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YFR057WYFR057W 456 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 RSM27YGR215W 333 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 LRP1YHR081W 555 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 SNO2YNL334C 669 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YBL108WYBL108W 306 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YPL197CYPL197C 414 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 NUT2YPR168W 474 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 PIG1YLR273C 1947 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 CDC24YAL041W 2565 nt0.55□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.54□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.54□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.54□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 HNT1YDL125C 477 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 MXR1YER042W 555 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 TAD1YGL243W 1203 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 TIM10YHR005C-A 282 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 NBL1YHR199C-A 222 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 RUF22RUF22 515 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 UBS1YBR165W 834 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 PAU24YBR301W 363 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 RIM20YOR275C 1986 nt0.53□□□□□ -2.32
LIP1Q03579 YDL206WYDL206W 2289 nt0.53□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YDL196WYDL196W 330 nt0.52□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.52□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YOR199WYOR199W 330 nt0.52□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.52□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 PRP16YKR086W 3216 nt0.52□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 BUD3YCL014W 4911 nt0.52□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 QCR7YDR529C 384 nt0.51□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 BI4Q0120 1917 nt0.51□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YHL037CYHL037C 402 nt0.51□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YKL111CYKL111C 336 nt0.51□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 SPC2YML055W 537 nt0.51□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.51□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 STO1YMR125W 2586 nt0.51□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 AIM44YPL158C 2277 nt0.51□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 MKT1YNL085W 2493 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 SEC1YDR164C 2175 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 SWF1YDR126W 1011 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YDR220CYDR220C 294 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YDR509WYDR509W 348 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YEL057CYEL057C 702 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YML003WYML003W 873 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YPR099CYPR099C 357 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.5□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 SCW11YGL028C 1629 nt0.49□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 RKR1YMR247C 4689 nt0.49□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YGL109WYGL109W 324 nt0.49□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 RPC10YHR143W-A 213 nt0.49□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 BMT5YIL096C 1011 nt0.49□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.49□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 FIG4YNL325C 2640 nt0.49□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 UBP3YER151C 2739 nt0.48□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YGR115CYGR115C 780 nt0.48□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YPT6YLR262C 648 nt0.48□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 HCH1YNL281W 462 nt0.48□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 POP7YBR167C 423 nt0.48□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 SLD3YGL113W 2007 nt0.48□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 PAN3YKL025C 2040 nt0.48□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 TTI1YKL033W 3117 nt0.48□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 ALY2YJL084C 3141 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 KAR1YNL188W 1302 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 snR5snR5 204 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YDR008CYDR008C 351 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 HIT1YJR055W 495 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YBR032WYBR032W 303 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YPR096CYPR096C 303 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 SLM6YBR266C 453 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 PDE2YOR360C 1581 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 SPO23YBR250W 1572 nt0.47□□□□□ -2.33
LIP1Q03579 MRPL32YCR003W 552 nt0.46□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 OCA6YDR067C 675 nt0.46□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YDR114CYDR114C 303 nt0.46□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YGL015CYGL015C 393 nt0.46□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YGL230CYGL230C 444 nt0.46□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 SDH2YLL041C 801 nt0.46□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YLR271WYLR271W 825 nt0.46□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 LYS14YDR034C 2373 nt0.46□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 snR84snR84 550 nt0.45□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YGR228WYGR228W 345 nt0.45□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 SDS22YKL193C 1017 nt0.45□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 PXA2YKL188C 2562 nt0.45□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 UTP10YJL109C 5310 nt0.44□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 GUP1YGL084C 1683 nt0.44□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 ENV11YGR071C 2583 nt0.44□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.44□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.44□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 MRPS8YMR158W 468 nt0.44□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 YBR071WYBR071W 636 nt0.44□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 RPL38YLR325C 237 nt0.43□□□□□ -2.34
LIP1Q03579 IES4YOR189W 351 nt0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.2 ms