Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ID3Q02535 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms