Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms