Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA4P83105 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA4P83105 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA4P83105 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA4P83105 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA4P83105 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA4P83105 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTRA4P83105 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms