Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUCB2P80303 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms