Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP2P63027 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAMP2P63027 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms