Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK1P57059 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIK1P57059 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK1P57059 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK1P57059 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK1P57059 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK1P57059 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK1P57059 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK1P57059 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK1P57059 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIK1P57059 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIK1P57059 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms