Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ATP5EP56381 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms