Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NCKAP1LP55160 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms