Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPAP53621 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPAP53621 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPAP53621 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPAP53621 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPAP53621 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COPAP53621 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COPAP53621 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COPAP53621 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COPAP53621 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms