Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
THOP1P52888 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THOP1P52888 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THOP1P52888 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THOP1P52888 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms