Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF138P52744 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms