Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RORCP51449 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RORCP51449 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RORCP51449 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RORCP51449 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RORCP51449 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RORCP51449 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RORCP51449 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RORCP51449 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RORCP51449 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RORCP51449 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms