Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCAMP50895 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCAMP50895 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCAMP50895 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCAMP50895 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAMP50895 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAMP50895 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAMP50895 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAMP50895 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAMP50895 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAMP50895 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAMP50895 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAMP50895 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCAMP50895 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BCAMP50895 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BCAMP50895 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BCAMP50895 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCAMP50895 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.4 ms