Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CRIP1P50238 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRIP1P50238 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms