Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GSK3BP49841 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms