Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD52P43351 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD52P43351 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD52P43351 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD52P43351 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD52P43351 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD52P43351 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD52P43351 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAD52P43351 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAD52P43351 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAD52P43351 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms