Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PBX2P40425 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PBX2P40425 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PBX2P40425 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PBX2P40425 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PBX2P40425 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PBX2P40425 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PBX2P40425 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PBX2P40425 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PBX2P40425 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms