Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT2P35908 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT2P35908 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT2P35908 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT2P35908 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT2P35908 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms