Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNNA1P35221 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNNA1P35221 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNNA1P35221 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms