Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCM5P33992 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM5P33992 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM5P33992 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM5P33992 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM5P33992 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM5P33992 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM5P33992 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM5P33992 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM5P33992 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM5P33992 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms