Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLIP1P30622 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms