Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF2E2P29084 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms