Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMBRP28336 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMBRP28336 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMBRP28336 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMBRP28336 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMBRP28336 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMBRP28336 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NMBRP28336 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NMBRP28336 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NMBRP28336 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NMBRP28336 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMBRP28336 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms