Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PSMA3P25788 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms