Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTSSP25774 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSSP25774 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSSP25774 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSSP25774 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSSP25774 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSSP25774 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSSP25774 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSSP25774 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSSP25774 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSSP25774 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSSP25774 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms