Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYF6P23409 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYF6P23409 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYF6P23409 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYF6P23409 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYF6P23409 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYF6P23409 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms