Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDK11BP21127 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK11BP21127 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms