Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NTF3P20783 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF3P20783 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF3P20783 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF3P20783 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF3P20783 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NTF3P20783 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NTF3P20783 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms